Оптимизировать работу БД на сайте

Есть мультидоменная система, после обновления версии CMS процессы БД стали сильно грузить процессор на сервере. Нужно разобраться в причинах и оптимизировать работу БД. Сейчас из оптимизации проведена только индексация.