Нужно извлечь из exe файла основной исходный код можно без библиотек и всего ненужного, а если не получится то воссоздать код на питоне и с правильным алгоритмом работы программы, это консольная программа, остальные вопросы задавайте в чате.
Операционная система: Windows(Server 2003)[AMD64, 64-битный, Консоль]
Упаковщик: Nuitka[Onefile]
Упаковщик: Packer detected(Heuristic)[High entropy + Section 10 (".rsrc") compressed]